В 11 сезоне сериала «Кости» прошло шесть месяцев после событий финала предыдущего сезона. Сили и Темперанс решили оставить свою работу в институте и службу в ФБР. У героев родился второй ребенок – мальчик Хэнк. Сили также тренирует новых рекрутов. Остальные члены команды тем временем расследуют нестандартные преступления и однажды обнаруживают сожженное тело, которое сначала идентифицируют как Бута. Вскоре доктору и специальному агенту предстоит вернуться к своей работе, чтобы продолжить раскрывать загадочные дела.