Действие мультфильма разворачивается в будущем. Мировое сообщество выступает против развития кибернетики и робототехники. Отныне все исследования в этой области - под строгим запретом. В знак протеста Япония разрывает все связи с другими странами и буквально исчезает с мировой арены. Американским разведчикам удается проникнуть на территорию закрытого государства и выяснить, что власть в Японии захватила корпорация “Дайва”. С помощью принудительного вакцинирования она превращает людей в андроидов. Агент Вексилл и участники сопротивления намерены этому помешать.

• Премьера мультфильма состоялась на 60-м международном кинофестивале в Локарно. После этого “Агент Вексилл” был закуплен для проката 75 странами, впоследствии их количество увеличилось до 129.
• В саундтрек мультфильма вошли композиции британского дуэта Basement Jaxx, австралийского коллектива Dead Can Dance, американского детройт-техно-музыканта Карла Крейга и других исполнителей. 
• Тема взаимодействия людей с искусственным интеллектом не впервые фигурирует в творчестве режиссера Фумихико Сори. В 2004 году он стал продюсером манги “Яблочное зернышко”, включающей элементы киберпанка.