Евреи находятся в рабстве у египтян. Чтобы в дальнейшем вовсе истребить еврейский народ, фараон приказывает убивать новорожденных младенцев. Желая спасти своего сына от гибели, Иохаведа кладет малыша в корзину и отпускает вдоль по течению. Жена фараона, нашедшая ребенка, решает воспитать его как родного и дает ему имя Моисей. Проходят годы. После смерти старого фараона на трон восходит его старший наследник Рамзес. Моисей же волею судьбы находит своих настоящих родственников и видит знамение, возвещающее, что он должен вывести евреев из Египта. Но сделать это будет не так просто…

• Над сценой, где Красной море расступается перед еврейским народом, работали десять аниматоров. На создание четырехминутной сцены у них ушло два года. 
• Мать Моисея, Иохаведу, озвучила известная израильская певица Офра Хаза. Она дублировала героиню не только в оригинальной версии, но и для проката мультфильма в других странах. В общей сложности она озвучила Иохаведу на семнадцати языках, заучивая реплики на слух. 
• Мишель Пфайффер подарила свой голос жене Моисея - Сепфоре. Работа над “Принцем Египта” стала первым опытом актрисы в дубляже мультфильма.
• Вэл Килмер озвучил сразу двух персонажей - Моисея и Бога.