Середина XVI века, Русское царство. Разгар Опричнины и Ливонской войны, голод и смута царят на землях Ивана Грозного. Оставшись без главы церкви после смерти митрополита Афанасия, царь Иван IV призывает в Москву друга детства, игумена Соловецкого монастыря Филиппа, чтобы предложить ему стать митрополитом Московским. Несмотря на опасения перед полубезумным царем, Филипп соглашается. Священнослужитель надеется, что ему удастся образумить царя и положить конец усобицам и царящей повсюду бессмысленной жестокости.

• Съемки фильма проходили в Суздале, где была построена декорация опричного дворца. По окончании производства произошел скандал, так как никто не хотел брать на себя расходы по демонтажу декорации.
• Рабочее название фильма - “Иван Грозный и митрополит Филипп”.
• Главная роль изначально писалась в расчёте на Петра Мамонова, с которым режиссер Павел Лунгин ранее неоднократно работал. По словам Лунгина, он увидел в актере черты царя во время съемок фильма “Остров”. 
• Последняя роль в кино Олега Янковского. Актер скончался 20 мая 2009 года, через три дня после показа фильма на Каннском фестивале.
• Готовясь к роли, Олег Янковский встречался с патриархом Алексием II и получил от него благословение на съемки.
• В конце октября 2009 года вышел роман сценариста фильма Алексея Иванова “Летоисчисление от Иоанна”, основанный на первоначальном варианте сценария фильма.