16-летний Сидо Ицука остался без родителей в раннем детстве и теперь живет с младшей сестрой Котори в пригороде Токио. Однажды из-за своей сестры он оказывается в самом центре катаклизма и узнает, что на Землю появляются таинственные Духи.