В основе сюжета сериала «Защищая Джейкоба» — история обвинения 14-летнего подростка Джейкоба в убийстве своего одноклассника. Его родителям приходится столкнуться с трудностями жизни под надзором и пристальным взглядом окружающих, которые им больше не доверяют. В эту историю замешан далеко не один Джейкоб, но его невиновность постоянно подвергается сомнениям, когда родители осознают, что они совершенно не знают, что происходит в голове их сына.