Герой сериала «Хороший доктор» – парень по имени Пак Щи-он, который страдает аутизмом. Часто он ведет себя как десятилетний ребенок, зато обладает уникальным медицинским талантом. Следуя своему призванию, Пак Щи-он становится первоклассным детским врачом. Однако в отношениях с людьми у него по-прежнему возникают существенные трудности. Девушка Чха Юн-со тоже работает в детской хирургии. Она решила посвятить свою жизнь медицине еще в школе. Между героями часто разгораются неразрешимые противоречия.