В 6 сезоне «Клиники» у героев происходят серьезные изменения в жизни. Эллиот начинает вести частную практику, что значительно улучшает ее финансовое положение. В то же время она вступает в серьезные отношения с молодым ординатором по имени Кит. Терк и Карла становятся родителями, а Кокс с Джордан ждут второго ребенка. У Джея Ди же начинается черная полоса в жизни, когда он остается без любимой девушки и возможности жить у Эллиот в квартире.